O Museu Histórico do Instituto Butantan foi criado em 1981 com a intenção de, por meio da educação e transmissão do conhecimento científico gerado pelo Instituto Butantan, desenvolver atividades de assimilação e interpretação sobre a ciência e a saúde pública paulista.

A iniciativa em criar um espaço de reflexão sobre a história do Instituto Butantan veio de encontro à necessidade institucional em resgatar e valorizar sua memória. Por isso, além da constituição de um acervo histórico composto de objetos tridimencionais, textos, fotos e filmes, disponíveis para a pesquisa, o Museu apresenta ao público uma exposição de longa duração que recria o primeiro laboratório do Butantan, local onde Vital Brazil produziu os primeiros soros e vacinas.  
Como espaço de educação não formal, dedicado à pesquisa em acervo e museologia, o Museu conta desde 2005 com equipe de profissionais formados nas áreas de história, pedagogia e jornalismo, interessados na pesquisa sobre a interface entre história e ciências.  
As principais atribuições do Museu Histórico são: 

• Desenvolver pesquisa nas áreas de acervo criando e aplicando metodologias adequadas a incorporação, guarda e preservação de todo o patrimônio documental de origem histórica do Instituto Butantan; 
• Desenvolver pesquisa na área de museologia por meio da investigação sobre metodologias e técnicas próprias de transmissão do conhecimento sobre o patrimônio cultural gerado no Instituto, bem como sobre as formas de comunicar e divulgar este patrimônio;  
• Disponibilizar o acervo à pesquisa atendendo a diversos públicos interessados no estudo da história do Instituto Butantan e da saúde pública paulista; 
• Criar atividades educativas com o objetivo em promover a participação dos visitantes e a integração da comunidade científica.